Попробуйте выполнить следующие действия:
избавиться от файла .desktop, который вы создали ранее. intellij idea перейти к инструментам и выбрать Create desktop Entry.. сказать «да», чтобы переопределить все, что было до этого, и выбрать option create for all users в диалоговом окнеИ вы должны увидеть значок в dash. Похоже, вы не сделали этого после установки приложения.