Я использую общесистемный прокси для работы в Интернете. Есть ли утечки DNS с этим?
Да, есть. Однако утечки происходят с прокси-сервера, а не с вашего компьютера.
Если прокси-сервер используется многими людьми, было бы несколько сложнее (хотя и не невозможно) связать утечки DNS с вами.