Программа не работает должным образом при запуске в терминале

Я использую программы на C ++, используя эмулятор терминала Gnome в Ubuntu 10.04. У программы есть несколько шагов, и я заставляю программу распечатывать что-то на терминале после каждого, чтобы сказать мне, как далеко он продвинулся. В конце он печатает в файл.

У меня часто возникают следующие две проблемы:

Программа зависает, когда я нажимаю на что-то, кроме терминала, или минимизирую его. Это видно по тому, что перестает печатать на экран. Программу можно легко разморозить, просто дважды щелкнув по терминалу.

Терминал гаснет, ничего не показывая, кроме курсора. Это мигает, вероятно, когда что-то новое должно быть напечатано на экране. Программа, похоже, все еще работает, так как в конце печатает в файл. Но иногда результаты, которые он печатает, не имеют смысла.

Кто-нибудь видел что-то подобное раньше и знает, какие проблемы это вызывают?