Нет, эти предупреждения вовсе не вредны для стабильности Ubuntu, Unity или Compiz. Фактически большинство предупреждений ничего не скажут: все «устаревшие» предупреждения говорят о том, что стандарты рекомендуют использовать единицы в файлах CSS; единственным предупреждением, которое может повлиять на внешний вид, является номер 6, строка 40 в unity.css, о 'sahde' является недопустимым цветом.