Проблема в том, что вы удалили рекурсивно / var / lib / apt / lists, которые также удалили частичный каталог. Итак, воссоздание каталога должно решить проблему:
sudo mkdir /var/lib/apt/lists/partial
sudo chmod 755 /var/lib/apt/lists/partial
Я бы сказал, что он зависит от варианта использования и того, как проекты связаны друг с другом. Если у вас есть несколько проектов, отделенных друг от друга, используйте разные PPA для каждого. Если все они связаны друг с другом, используйте один PPA.
Если вы посмотрите на tualatrix PPA, вы увидите, что для каждого проекта есть пакет:
https://launchpad.net/~tualatrix
перечисляет следующие [!d3 ] Личные архивы пакетов PPA for Software Center PPA named daily for Ding Zhou GIMP Fcitx Gimpanel GNOME Shell GNOME Terminal with Google Search Support iBentu PPA libnotify MeeGo Nautilus Tualatrix's Next PPA PPA for Personal Use Ubuntu Tweak Stable PPA VPN Indicator Wayland Unofficial PPA
Я бы сказал: 1 PPA для 1 проекта.