Почему окна идут вверху слева от экрана?

Нелегко сказать. Но, как правило, ответ - это простые обновления, не имеющие большого значения, не будут помещаться в хранилища уже выпущенной версии Ubuntu.

Три примечательных исключения из этого: Firefox, Thunderbird и Chromium. Причина этого в том, что у них есть графики «быстрого выпуска» (новые версии каждые несколько недель). Было бы небезопасно, чтобы команда безопасности Ubuntu постоянно резервировала исправления безопасности для более старых версий.