Как зашифровать систему с двойной загрузкой?

Я не вижу, как избежать обработки Windows и Ubuntu отдельно с помощью программного обеспечения.

• Установка TrueCrypt для Windows. Например, это «Как использовать TrueCrypt для шифрования всей системы Windows» .
• Установите Ubuntu, используя альтернативный образ установщика. Я рекомендую вам использовать LVM, так как это позволяет иметь все разделы (затем LV) в одном контейнере dm-crypt. Требуется раздел /boot, но LVM избавляет вас от большего. Прочтите эту статью, как это сделать: «Как установить Ubuntu 11.04 в зашифрованную файловую систему LVM» (хотя и немного устаревший, но все еще актуальный для 12.04).

В качестве альтернативы, получите дорогой самошифрующийся жесткий диск , разблокированный BIOS во время загрузки, если он поддерживается. Таким образом, ваша ОС не требует настройки, и вся обработка (шифрование / дешифрование) выполняется жестким диском, а не вашим процессором.