Я заметил это, в основном, когда играл в флеш игры в моем firefox или играл в x-com в dosbox. Игра просто работает нормально, но потом вдруг начинает замедляться. Когда я прикасаюсь к сенсорной панели и перемещаю курсор, все становится хорошо. Но когда я отпускаю тачпад, он снова начинает ползти.
Возможно, вы настроили фоновый процесс для запуска, когда компьютер не используется. Также может случиться так, что ваша заставка не очень хорошо работает с вашей конфигурацией, и она пытается загрузить и замедлить работу компьютера.