У меня странная проблема с индикаторами приложений в Unity. Например, индикатор Google Chrome отображается только на левом (основном) мониторе, и нажатие на него с помощью RMB / LMB работает, как ожидается. Однако Synapse, Dropbox и Feedindicator не реагируют ни на какие нажатия, и отображаются на обоих дисплеях. Их можно использовать через правый (вторичный) монитор, но это довольно раздражает.
Я установил для systray-whitelist значение ['all'], так как я CBA занесен в белый список для приложения-на-базе, и это когда проблема началась (я уверен, что могу нажать Dropbox на обоих мониторах, но потом снова, когда это не был белый список, я думаю, что он использовал новую систему вместо индикатора апплета).
Похоже, это решило себя сейчас. Я не вносил никаких изменений и регулярно перезагружал машину, поэтому, должно быть, было какое-то обновление или просто "волшебство". :)