Должна ли точка монтирования быть пустым каталогом?

Нет, это не обязательно должен быть пустой каталог. Вы можете «смонтировать» его, но имейте в виду, что вы изначально скрываете файлы в этом каталоге.

Это может привести к некоторой путанице, поскольку пространство в основной файловой системе, а не в только что смонтированной, остается занятым.