Я предполагаю, что вам нужно поместить это в автозагрузку приложений, но я не совсем понимаю, как это сделать.
Перейдите в Система → Настройки → Запускаемые приложения и нажмите кнопку Добавить . Вы увидите что-то вроде этого:
Имя и комментарий предназначены для того, чтобы вы могли распознать его в списке запускаемых приложений
. Команда для эмпатии просто empathy
Если вы не уверены в команде, вы можете запустить приложение, откройте Системный монитор и проверьте запись Команда в список процессов.