при входе в систему нажмите на логотип ubuntu рядом с вашим именем и выберите док-станцию cairo. Теперь он должен показывать только док.
Под «темой Cairo-Dock» вы подразумеваете «сессию Cairo-Dock» ;-) кажется, что Ubuntu снова включает Unity по умолчанию, даже если это не так. это ошибка, и ее следует сообщать на Launchpad. Как было сказано выше, просто повторно отключите плагин Unity в Compiz.