Попробуйте Xournal
Вы можете комментировать, выделять, подчеркивать, рисовать .......
Установить, набрав
$sudo apt-get install xournal
О сообщении об ошибке feh: попробуйте изменить theme.wallpaper_cmd в вашей теме.lua на {""}. Услуги Gnome будут устанавливать обои для вас без какой-либо помощи (по крайней мере, это работает в 12.10)