Выполнение аналогичного анализа [дубликат]
На этот вопрос уже есть ответ:
У меня есть папка с несколькими подпапками и файлами. Все они похожи по названию, но разница только в номере пациента
Пример
Analysis/Patient_01/Brain/image_patient_01_merged.nii
Analysis/Patient_02/Brain/image_patient_02_merged.nii
Analysis/Patient_03/Brain/image_patient_03_merged.nii
.
.
.
и так далее.
В основной папке ( Анализ ) я хочу создать сценарий, который будет делать то же самое для каждого файла .nii в цикле.
example
fslstats image_patient_01_merged.nii -M
fslstats image_patient_02_merged.nii -M
fslstats image_patient_03_merged.nii -M
.
.
.
.
Другими словами, мне нужно провести такой же анализ файлов nii в каждом подкаталоге.
2
задан Ali Radaideh
22 November 2017 в 16:45
поделиться
1 ответ
Используя bash, в папке Analysis используйте простой цикл for:
for f in */*/*.nii
do
flstats "${f##*/}" -M
done
*/*/*.nii расширится до Patient_01/Brain/image_patient_01_merged.nii и т. Д., А ${f##*/} получит только имя файла image_patient_01_merged.nii из этого.
2
ответ дан muru
22 November 2017 в 16:45
поделиться