вы можете использовать команду sudo в начале вашей командной строки для запуска чего-то как root;
i.e. #sudo service nginx start
Если вы хотите запускать как root «все время» (не очень хорошая идея), вы можете установить пароль для пользователя root (sudo passwd), а затем войти в систему или su для root.
Если вы просто хотите запустить эту службу как «постоянно», вы можете добавить ее в /etc/rc.local, и это запустит службу с правами root во время загрузки?
Надеюсь, это поможет.