На этот вопрос уже есть ответ здесь:
Как удалить раздел Windows из Ubuntu? У меня есть вирус ФБР в моем разделе Windows, и мне нужно удалить его из ОС Ubuntu.
Вы должны быть в состоянии сделать это из gparted. Вы также можете запустить загрузочный компакт-диск Ubuntu и использовать gparted оттуда.