На этот вопрос уже есть ответ здесь:
Есть ли (или нет) поддержка для шифрования всего загрузочного / системного диска с помощью Truecrypt в Ubuntu?
Поддержка полного системного шифрования в настоящее время доступна только для Windows, посмотрите на этот ответ для суперпользователей .
Если вы заинтересованы в полностью зашифрованной системе Linux, вам придется использовать LUKS.
Итак, чтобы ответить на ваш вопрос: нет, в настоящее время это невозможно.