Проблема с тем же именем хоста и доменом

Когда я настраивал свой производственный сервер, имя хоста совпадало с именем одного домена, который не планировалось использовать, но теперь я должен использовать это имя домена, и файлы хранятся в каталоге /var/www (root каталог) и у меня проблемы с разрешениями.

Я думал об изменении имени хоста сервера на другое и создании нового домена через ispconfig (/var/www/client#/domain). Решит ли это проблему с указанием /var/www при переходе на адрес домена, или мне придется использовать другой подход?

Мой сервер - Ubuntu 12.04, настроенный с этим руководством .