Я заметил здесь несколько ошибок в Ubuntu 12.04LTS LibreOffice, он всегда открывается с запросом на получение документов в файле .odf - это связано с тем, что установлена openjdk java.
Это - нормальное поведение, если Libreoffice закрывается, прежде чем документ сохраняется. Ничто иное не должно влиять на него. Что сделало Вы делаете в последнем случае, который Вы открыли и закрыли, Libreoffice - то, что необходимо сказать нам.