это может звучать как странный ответ, но я просто столкнулся с такой же проблемой - на это стоит взглянуть.
убедитесь, что Вы не иметь приложение usbmount, установленные - это, кажется, привести к конфликтам и подключает USB-накопители к "USB на папки#", что вы упомянули.
Более подробная информация доступна в соответствующем убунту форумах.