выполнение сценария HPC

Я пытаюсь запустить сценарий в течение длительного времени на HPC slurm на разделе --partition = lowpri, но когда я проверяю очередь запуска, она показывает, что она работает на partition = hipri в течение короткого времени, и прерывается через 3 часа. .

Я не могу понять, что здесь не так:

$ squeue -j 17190
   JOBID PARTITION     NAME     USER ST       TIME  NODES NODELIST(REASON)
             17190     hipri dada2_ru  30771  R       0:11      1 node020


script:

#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=dada2_run
#SBATCH –-ntasks=10
#SBATCH --mem-per-cpu=20G
#SBATCH --partition=lowpri
#SBATCH --time=300:00:00
#SBATCH --output=/users/3052771/sharedscratch/Amplicon_data_july_2019/PN0086C_16S-137179427/Amplicon_2019_RNAseq

module load apps/qiime2/2019.4.0/bin

qiime dada2 denoise-paired --i-demultiplexed-seqs demux.qza --o-table table.qza  --o-representative-sequences rep-seqs.qza --p-trim-left-f 19 --p-trim-left-r 20  --p-trunc-len-f 232 --p-trunc-len-r 174 --verbose --output-dir dada_result

спасибо

0
задан 24 July 2019 в 11:51

0 ответов

Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: