На этот вопрос уже есть ответ здесь:
Могу ли я использовать настольную версию Ubuntu linux в своей офисной среде, мне не нужна расширенная поддержка для моих настольных компьютеров.
Да, можно использовать его бесплатно.
Однако, почему бы не рассмотреть пожертвование проекту Ubuntu, если Ваша компания использует его и делает деньги? Часть того, что Вы оплатили бы Windows, например? Или купите поддержку, тот способ, которым Вы выделили людей в Каноническом для заботы о Вас.