Очевидно, что ваш grub.cfg не содержит записи для Windows, и этого не должно быть, потому что Windows находится на другом жестком диске.
Вам нужно вручную отредактировать файл grub.cfg.
Запустите sudo lshw -C disk и узнайте Physical id на жестком диске, на котором установлена Windows.Запустите sudo lshw -C disk и узнайте Physical id на жестком диске, на котором установлена Windows. Добавьте в файл следующую запись: [ f1] Здесь X - physical id жесткого диска, а Y - номер раздела, где установлена Windows.
Перезагрузите и проверьте.
В параметрах Guake убедитесь, что используется «интерпретатор по умолчанию». Также, возможно, проверьте, что ваша оболочка пользователя: «finger» должен предоставить ее вам.