Могу ли я безопасно хранить и отображать файл главного пароля с AES-зашифрованным файлом плюс несколько простых сценариев bash?

Да. Вам может повезти, и это может быть вызвано неправильным подключением, поэтому удалите ОЗУ, очистите его, подключите и снова проверьте. Но не рассчитывайте на это, вам, скорее всего, придется его заменить.