На этот вопрос уже есть ответ здесь:
каков простой способ отключить синий зуб при запуске с Ubuntu 13.10.
Вы можете найти ответ здесь . В итоге:
sudoedit /etc/rc.local
exit 0
строку: rfkill block bluetooth
Теперь Bluetooth должен быть отключен при запуске.