Для Lubuntu с LXDE:
own_window yes
own_window_class Conky
own_window_transparent yes
own_window_type desktop
double_buffer yes
Если окно conky исчезает, когда кнопка нажатия сводит к минимуму все окна (показать рабочий стол), перейдите в «Настройки»> «Приложения по умолчанию для LXsession-> Запуск приложений -> Рабочий стол и выберите «feh» вместо «filemanager»
Работайте со мной в Lubuntu 13.10.