Технически это может произойти, потому что между пакетами Mate Desktop и пакетами «Ubuntu Repository» нет никакого конфликта. Я думаю, что это зависит от команды разработчиков Ubuntu и ее отношения к команде разработчиков Mate Desktop, но я считаю, что это не так, потому что популярность программного обеспечения приведет к добавлению ее пакетов в официальный репозиторий Ubuntu.