На самом деле я хочу перейти на недавно выпущенную Ubuntu 14.04 с дерзкой 13.10 версии. Что касается того, что я никогда не сталкиваюсь с процессом обновления с * nix версии до следующей, я хочу, чтобы вы любезно исправили, какие файлы будут изменены в этом процессе обновления:
Неофициальные repos отключены во время обновления.
я не уверен в Вашей второй точке. К каким источникам Вы обращаетесь? Действительно ли это - ppa источники? Да они сохранены, но отключены.
После того, как обновление завершено, можно проверить состояние тех ppas из "Источников программного обеспечения" и повторно включить им. Я предполагаю, что необходимо будет произвести чистку gnome3 ppas при использовании их перед обновлением.
можно использовать инструмент, названный y ppa менеджер, которого Вы могли бы найти полезным для позволения/запрещения отдельного ppas (ppa:webupd8team/y-ppa-manager).