ограничить пользователя auth до ~ / public_html

В Ubuntu 16.04 эта последовательность должна избегать интерактивного диалога:

export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive
apt-get update
apt-get upgrade -yq

Обратите внимание, что флаг -q важен.

(Ссылка: этот вопрос на дефолтах)