У вас такая же эргономическая проблема!
Ctrl + D или Add Bookmark будут работать только тогда, когда на панели местоположения выбрана «желаемая ссылка». «Закладки» появятся только на «Местах» (Nautilus) после размещения одной закладки. Не очень дружелюбный IMO ...
Ссылки: «Добавление закладки
Чтобы добавить закладку, откройте папку или папку, которую вы хотите пометить, затем выберите« Места »->« Добавить закладку » .
Если вы используете окно браузера Nautilus, выберите «Закладки»> «Добавить закладку». От: http://linux.about.com/library/gnome/blgnome6n6p.htm
И http://linux.about.com/library/gnome/blgnome6n6p.htm [!d7 ]
И, наконец, Справка от Ubuntu: Ubuntu Desktop Guide »Файлы> Советы и вопросы» Редактировать закладки в папке
Это почти дублируется: закладки Nautilus вообще не отображаются? [ ! d11]