hidepid

procfs на Linux теперь поддерживает hidepid опция. От man 5 proc:

hidepid=n (since Linux 3.3)
      This   option   controls  who  can  access  the  information  in
      /proc/[pid]  directories.   The  argument,  n,  is  one  of  the
      following values:

      0   Everybody  may  access all /proc/[pid] directories.  This is
          the traditional behavior, and  the  default  if  this  mount
          option is not specified.

      1   Users  may  not  access  files and subdirectories inside any
          /proc/[pid]  directories  but  their  own  (the  /proc/[pid]
          directories  themselves  remain  visible).   Sensitive files
          such as /proc/[pid]/cmdline and /proc/[pid]/status  are  now
          protected  against other users.  This makes it impossible to
          learn whether any user is running  a  specific  program  (so
          long  as  the program doesn't otherwise reveal itself by its
          behavior).

      2   As for mode 1, but in addition the  /proc/[pid]  directories
          belonging  to other users become invisible.  This means that
          /proc/[pid] entries can no longer be used  to  discover  the
          PIDs  on  the  system.   This  doesn't  hide the fact that a
          process with a specific PID value exists (it can be  learned
          by  other  means,  for  example,  by "kill -0 $PID"), but it
          hides a process's UID and  GID,  which  could  otherwise  be
          learned  by  employing  stat(2)  on a /proc/[pid] directory.
          This greatly complicates an  attacker's  task  of  gathering
          information   about  running  processes  (e.g.,  discovering
          whether some daemon is  running  with  elevated  privileges,
          whether  another  user  is  running  some sensitive program,
          whether other users are running any program at all,  and  so
          on).

gid=gid (since Linux 3.3)
      Specifies  the  ID  of  a  group whose members are authorized to
      learn  process  information  otherwise  prohibited  by   hidepid
      (ie/e/,  users  in this group behave as though /proc was mounted
      with hidepid=0.  This group should be used instead of approaches
      such as putting nonroot users into the sudoers(5) file.

Так, монтирование /proc с hidepid=2 достаточно должен скрыть детали процессов других пользователей на Linux> 3.3. Ubuntu 12.04 идет 3.2 по умолчанию, но можно установить более новые ядра. Ubuntu 14.04 и выше легко соответствует этому требованию.

ACLs

Как первый шаг, удалить rwx полномочия для других из каждого корневого каталога (и для группы также, если Вы требуете его). Я предполагаю, конечно, что папка (папки), содержащая корневые каталоги, не имеет полномочий записи никому кроме корня.

Затем сервисы предоставления как веб-сервер и доступ почтового сервера к соответствующим каталогам с помощью ACLs. Например, для предоставления веб-сервера обрабатывают доступ к пользовательским домашним страницам, принимая www-data пользователь и ~/public_html то, где домашняя страница сохранена:

setfacl u:www-data:X ~user
setfacl d:u:www-data:rX ~user/public_html

Точно так же добавьте ACLs для почтовых процессов и каталогов почтового ящика.

ACLs включены по умолчанию на ext4, по крайней мере, на Ubuntu 14.04 и выше.

/tmp и umask

Другая проблема /tmp. Установите umask так, чтобы файлы не были группой - или читаемый миром, так, чтобы временные файлы пользователей не были доступны для других пользователей.

С этими тремя настройками пользователи не должны мочь получить доступ к файлам других пользователей или исследовать их процессы.