Моя ОС будет отформатирована, если я разделю свой корневой каталог в режиме восстановления?

Asumming корневой раздел (/раздел) установлен на отдельном разделе, ответ, не, необходимо быть в порядке для движения! Только для проверки смотрят на fstab файл с командой: cat /etc/fstab только, чтобы дать Вам пример необходимо искать что-то как:

 /dev/sda1 /
/dev/sda2 /home

или

UUID=a /

UUID=b /home

, где не равный b.