На этот вопрос уже есть ответ здесь:
Как сделать файловую систему NTFS с размером кластера 512? Используете только командную строку?
Существуют некоторые mkfs.*
команды, включая mkfs.ntfs
для создания разделов, они поддерживают много опций, смотрят на их страницы справочника.
Для создания раздела с размером кластера 512:
mkfs.ntfs -c 512 /dev/sdXX