Метод резервного копирования списка источников уже описан garbagecollector (также обратите внимание на дополнительный каталог, как объяснил Хавьер Ривера).
Чтобы создать резервную копию доверенных ключей, добавленных в вашу систему, вы можете использовать программу командной строки apt-key. Я не знаю, есть ли способ сделать это из графического интерфейса.
С терминала вы можете запустить что-то вроде этого:
sudo apt-key exportall > ~/repositories.key
Тогда на вашей другой системе вы должен иметь возможность импортировать этот ключевой файл из Software Sources или снова использовать apt-ключ:
sudo apt-key add /path/to/repositories.key
У меня есть только одна настольная система Ubuntu, поэтому я не проверял это, но я думаю, что это должен работать.