Печатающий гve been reinstalling things like the text and the file менеджер, and now I get these gray bars when scrolling to the edge.
Это - анимация прокрутки. Наутилус и gedit теперь включают эффект для того, когда Вы прокручиваете. Если, однако, Ваша тема GTK не совместима с теми анимациями, который происходит. Просто обновите свою тему или переключите ее для другого.