Буднее резервное копирование для / домой и / и т.д.

Если Ваш ПК работает все время, можно попробовать (как корень)

crontab -e

для запуска редактора крона. Крон является сервисом, который выполняет сценарий в настроенное время или после того, как интервал времени закончился.

Теперь добавляют, что строка, подобная

# m h dom mon dow    command
  0 1   *   *  0      /root/mybackupscript.sh 2> /dev/null

Затем, создает/root/mybackupscript.sh:

#/bin/sh
# Very simple backup script
rsync -va /home /etc /media/<user>/anotherdisk

Вот именно principially. Я не знаю, где Ваш "другой диск" смонтирован в дерево каталогов, поэтому измените его к своим потребностям.

крон и rsync являются также очень мощными и гибкими инструментами, не забывайте читать страницы справочника:

man crontab
man rsync