У меня была такая же проблема, и я нашел решение здесь: http://ubuntuforums.org/showthread.php?p=4779965
Обратите внимание, что на Ubuntu 12.04.1 вам не нужно менять ваш .bashrc (bash-скрипт уже заботится о файле .dircolors в домашнем каталоге).
Так просто:
> dircolors --print-database > ~/.dircolors
> vi ~/.dircolors
и изменить следующие строки: