Вот как вы на самом деле это делаете, скажем, mutter:
_P=mutter &&
(cat /var/log/dpkg.log{,.1};zcat /var/log/dpkg.log.*.gz) |
egrep --text "^[^ ]* [^ ]* (configure|install|remove|status [^ ]*|trigproc|upgrade) $_P[: ]" |
sort --reverse | less
Использование dpkg.log захватывает операции, которые apt-get не видит.
Выход:
2016-12-20 09:47:35 status unpacked mutter:amd64 3.22.2-2ubuntu1~ubuntu16.10.1
2016-12-20 09:47:35 status installed mutter:amd64 3.22.2-2ubuntu1~ubuntu16.10.1
…
Проверьте настройки системы с помощью настроек Window Manager. На последней вкладке «Композитор» вы включили компоновку дисплея?