Почему apt не знает, что у меня есть некоторые приложения, уже установленные из источников?

Хорошо, я нашел более простой ответ. Я запускаю Ubuntu 14.04, с новой установки (установленной вчера вечером). Я упал в Oracle Java 8 с помощью инструкций, найденных здесь: Установка Oracle 8 Java в Ubuntu

Затем я установил Freemind из программного центра и получил точную ошибку в исходном сообщении. Чтобы устранить проблему, я сделал следующее:

Я отредактировал следующий файл AS ROOT (но вы можете использовать свой редактор по выбору, gedit работает отлично, если вы хотите):

Я добавил эту строку перед первым оператором if (для меня строка 18, но ваша может отличаться)

export JAVA_CMD=/usr/bin/java

Теперь, когда Я нажимаю на значок Freemind в Unity, он работает.

Наслаждайтесь!