Как я заставляю GVim использовать значок в моей знаковой теме?

Это - известная проблема. Обходное решение упоминается в gnome-look.org страница Фаэнци:

• Некоторые приложения настроены, чтобы всегда использовать тот же значок независимо от выбранной темы: например, энергия, emacs23, gcolor2, голубая рыба, hardinfo, обороноспособность, gufw, pithos, goldendict, rssowl, picasa, netbeans, гаспачо.
• Для отображения значка Фаэнци отредактируйте как корень /usr/share/applications/application_name.desktop файл и определяет местоположение начала строки 'со Значка ='. Замените имя значка полного пути тем значка Фаэнци (обычно, это - название самого приложения) без расширения.
• Не забывайте делать резервное копирование прежде, чем изменить один из тех файлов.
• В некоторых случаях необходимо повторно инициализировать объект в редакторе меню Gnome для отображения нового значка.
• Файл на рабочем столе Vim /usr/share/applications/gvim.desktop