Там какой-либо путь состоит в том, чтобы изменить регион действия указателя мыши?
У меня есть круговой указатель с точкой в центре, и я хочу, чтобы мышь запустила щелчок действия оттуда, не от верхнего левого угла, должен там так или иначе установить это поведение?
Я полагаю, что "горячая точка" курсора определяется в самом файле курсора, таким образом, должна быть проблема с пользовательским курсором, который Вы используете.
Посмотрите это для получения инструкций относительно того, как создать Ваш собственный курсор - как Вы видите, координаты X и Y горячей точки указаны в файле конфигурации, который используется для создания курсора.
Вот поток о создании Вашей собственной темы курсора - http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=1440110