Двигатель WD Black² Dual Drive всегда останавливается и запускается

Это происходит потому, что ваши задания cron создают выходные данные, а затем демон cron пытается отправить вам этот вывод (т. е. root). Если вам не нужен этот вывод, самый простой способ решить это - отбросить его в crontab:

sudo crontab -e

и добавить >/dev/null 2>&1 к каждому заданию:

* * * * * yourCommand >/dev/null 2>&1