На этот вопрос уже есть ответ:
Я знаю, что могу просто нажать CTRL + H , чтобы скрыть скрытые файлы, но как сделать их видимыми по умолчанию?
Я использую Ubuntu 16.04.
Перейдите в Редактирование -> Настройки . Затем выберите "Выставочные скрытые файлы и файлы резервных копий" на вкладка Views для постоянной установки этого. Можно читать больше на настольное руководство GNOME также.