Существует ли файл конфигурации, который управляет микрофоном?

Можно использовать "pulseaudo" для достижения этой цели:

amixer -D pulse set Capture nocap

выключает Ваш микрометр.

можно просто поместить его где угодно, который будет выполнен при запуске, например: .profile.

, Если Вы хотите включить его снова, используйте:

amixer -D pulse set Capture cap

и для переключения между на и прочь:

amixer -D pulse set Capture toggle