ошибка для того, чтобы не использовать удар?

Я пытаюсь установить программное обеспечение, которое не имеет никакой поддержки до сих пор. Программным обеспечением является отсюда http://proteomics.ethz.ch/cgi-bin/xquest2_cgi/installation.cgi

Это - то, что они упомянули для следования:

[...] В этом разделе описываются установку в основанных на Unix системах. Для установки на единственной машине мы рекомендуем использовать Ubuntu в качестве ОС.

a. Установите необходимые пакеты Perl

Необходимые пакеты Perl перечислены здесь: Установка Пакетов Perl эти пакеты жемчуга в Вашей системе (например, при помощи cpan). Дополнительно необходимо установить подверсию и dos2unix (в системах Linux). При использовании Ubuntu можно загрузить и выполнить install_packages.sh сценарий оболочки. Этот сценарий установит все необходимые пакеты и программы. [...]

Здесь можно загрузить install_packages.sh, затем изменяют разрешение, которое позволяет Вам выполнять его. Я загрузил это и поместил его в мой рабочий стол. Затем я щелкаю правой кнопкой по нему, выбираю "Свойства" и затем изменяю разрешение. Впоследствии, я открыл терминал и установил его на рабочий стол.

cd desktop 
#then
./install_packages.sh  

и это внутренние пакеты

## apache
sudo apt-get install apache2
sudo apt-get install libapache-session-perl
## other
sudo apt-get install bioperl
sudo apt-get install libberkeleydb-perl
sudo apt-get install libcgi-fast-perl
sudo apt-get install libcgi-session-perl
sudo apt-get install libdata-dumper-concise-perl
sudo apt-get install libdata-dumper-simple-perl
sudo apt-get install libhtml-template-perl
sudo apt-get install libfile-copy-recursive-perl
sudo apt-get install libgd-graph-perl
sudo apt-get install libio-compress-bzip2-perl
sudo apt-get install libio-compress-perl
sudo apt-get install libtemplate-perl
sudo apt-get install libxml-treebuilder-perl
sudo apt-get install libxml-writer-perl
sudo apt-get install libmldbm-perl
sudo apt-get install libstatistics-descriptive-perl
sudo apt-get install libcgi-formbuilder-perl
sudo apt-get install libmail-sender-perl
sudo apt-get install build-essential
"~/Desktop/install_packages.sh" 42L, 1279C 

[...] необходимые пакеты и программы.

b. Установка xQuest/xProphet

• Создайте каталог, где xQuest/xProphet будет установлен. например,/home/xquest/xquest
• Загрузите zip или папку tar от раздела загрузки. и копия в каталог установки.
• Разархивируйте папку. Структура затем будет/VERSION/xquest/...
• изменитесь на / папку установки. Отредактируйте первую строку "install_xquest.sh" сценария и выполните его.Пожалуйста, примите во внимание: Этот сценарий выполняет/cgi/changeheader.pl, который изменяет заголовок cgi файлов, если Ваш путь установки для жемчуга не является/usr/bin/perl, необходимо отредактировать сценарий.
• Добавьте/xquest/bin каталог к своей переменной ПУТИ, так, чтобы программы могли быть найдены. [...]

Вот то, что я сделал:

sudo mkdir /home/xqxp/
cd /home/xqxp
sudo mkdir xquest

sudo cp /home/user/Desktop/V2_1_1.zip /home/xqxp/xquest/ -r

sudo apt-get install unzip

cd /home/xqxp/xquest/
sudo unzip V2_1_1.zip


# give the permistion to the folder 
sudo chmod -R o+rw /home/xqxp/xquest/V2_1_1/xquest/installation
# you can change the permission by
gksu nautilus

#and then I did
./install_xquant.sh

# add the directory to the profile 
gedit ~/.profile

#then add this 
PATH="$HOME/bin:$HOME/.local/bin:$PATH:/home/xqxp/xquest/V2_1_1/xquest/bin" 

Теперь я следую за структурой, как выполнить ее, http://proteomics.ethz.ch/cgi-bin/xquest2_cgi/howtorun.cgi создал папку в моем рабочем столе.

cd Desktop/
mkdir testm
cd testm/

Я копирую и прошлые два файла xmm.def и xquest.def к testm папке, и я работаю, или я не копирую их, потому что-getdef предполагают, чтобы сделать это

runXquest.pl –getdef 

Я получаю эту ошибку:

 Error: Cannot find/read the file ./MASTER_RUN/MASTER_RUN.txt

И если я делаю:

runXquest.pl -getdef

Я получаю эту ошибку

Current Server: xquestvm
cannot open file /home/xqxp/logs/usage.log No such file or directory at /home/xqxp/xquest/V2_1_1/xquest/bin/../modules/Common.pm line 83.

Что еще я должен сделать для установки xQuest/xProphet?