Почему я не могу войти в систему с одним пользователем, но с другим пользователем, используя ssh-ключи?

Если вы хотите разделить данные и операционную систему, создайте /, равную 50 G. И придерживайтесь остальных в /home.

Все данные будут в вашем домашнем каталоге.

Вы можете изменить размер разделов позже, если вам нужно, но это PIA. 50G более чем достаточно, если все ваши данные находятся дома.