Вы скорее всего удалили только свои личные настройки. Создайте нового пользователя и войдите в него как этот пользователь и проверьте, все ли в порядке. Это должно быть.
Если это сценарий, вы можете переместить ваши файлы, а не-missing-config-файлы в новую папку пользователя.