Нуждаюсь в помощи добавляя переменную $PATH
Я хочу добавить /data/biocs/b/bio425/bin к $PATH переменная в .bash_profile файл (использование vi или emacs).
Что я сделал, до сих пор
vi .bash_profile
и затем я попытался добавить /data/biocs/b/bio425/bin к моему $PATH:
# .bash_profile
# Get the aliases and functions
if [ -f ~/.bashrc ]; then
. ~/.bashrc
fi
# User specific environment and startup programs
PATH=$PATH:$HOME/bin:../../bio425/bp-utils
export PATH
PATH=$PATH:$HOME/bin:../../data/biocs/b/bio425/bin
export PATH
Я затем сохранил и конечно получил файл. Затем я пытался выполнить команду long-orf mystery_seq1, но я добрался
long-orf: command not found
Я делаю что-то не так с моим $PATH переменная?
1 ответ
Вы не можете использовать относительные пути в $PATH. Ну, Вы можете, но каждый раз система затем пытается искать команду, она попытается разрешить запись относительного пути там на основе Вашего текущего рабочего каталога, который может быть чем-либо.
Также не копируйте $HOME/bin запись.
Обратите внимание обычно размещение пользовательских путей перед значением по умолчанию (т.е. перед старым $PATH), так, чтобы у них был более высокий приоритет. Я не знаю, предназначается ли, что Вы помещаете их в последний раз.
Вы не должны реэкспортировать переменную также, этот уже экспортирован (хотя она не причиняет боль).
Таким образом, все, в чем Вы нуждаетесь, должно быть должно изменить вторую половину Вашего файла к этому:
# User specific environment and startup programs
PATH="$HOME/bin:/data/biocs/b/bio425/bin:$PATH"