На этот вопрос уже есть ответ здесь:
после установки нескольких пакетов с помощью менеджера пакетов, некоторые другие с помощью яиц, некоторые другие с помощью pip, для 2 версий python, с некоторыми пакетами, которые тем временем изменили имя (iPython --> Jupyter)... кратко, моя установка python находится в беспорядочном состоянии!
Как мне сбросить системный и локальный python на стандартный ubuntu 14.04 ?
Как указано здесь можно удалить пакеты, установленные зернышком с этой командой:
pip freeze | xargs pip uninstall -y