Мы можем установить Немо или Наутилус, для показа скрытых файлов на каталог?

Я не полностью понимаю Вашего вопроса, но если Вы хотите отобразить скрытые файлы, введите Ctrl-H.

По умолчанию это переключает дисплей скрытых файлов в большинстве файловых менеджеров, включая Наутилус и Немо.

В Наутилусе, "показывают/скрывают, что файлы" глобальны, и даже относятся к диалоговым окнам файла. Таким образом, там наверняка, Вы не можете установить его на на основание папки.

В Немо существует опция в предпочтениях под "Поведением" для "Игнорирования предпочтений представления на папку". Я не уверен, относится ли та установка также к показу/сокрытию скрытых файлов, но можно проверить, что установка выключена, и посмотрите, заставляет ли это Немо также помнить установку на основе на папку. Поскольку мне не установили Немо, я не могу проверить в это время.